Обито является сиротой, так как его родители умерли при неизвестных обстоятельствах. В аниме, мальчика воспитывает бабушка. Учиха Обито опаздывает на церемонию поступления в Академию Ниндзя. Там, он встречает всех своих будущих одноклассников, включая Хатаке Какаши и Рин. Последняя дает ему сертификат о поступлении в Академию. Обито с первого взгляда влюбляется в эту девочку.

Он опаздывает на второй этап Чунин Шикен, так как помогает старушке отнести сумку, тем самым, разозлив Какаши. Его команда, состоящая из Какаши и Рин, сражается против команды Гая, Генмы и Эбису. Затем, Гай с лёгкостью побеждает Обито. Рин же залечивает его раны, и, вскоре, Обито решает стать Хокаге. Он начинает усердно тренироваться.

Во время третьего этапа Чунин Шикен, Обито сражается с Майто Гаем, но тот быстро побеждает его, и становится Чунином. Тем не менее, Обито вновь усердно тренируется, и, в конечном счёте, становится Чунином. Когда он решает признаться Рин в любви, та просит его помочь в подготовке сюрприза для Какаши, так как тот стал Джонином, чему Обито не очень рад.

Третья мировая война Ниндзя

Он состоял в команде с Хатаке Какаши и Рин, и был учеником Намиказе Минато. Он постоянно опаздывал на миссии, что очень раздражало Какаши. Тем не менее, Обито и Какаши являлись кем-то вроде лучших друзей. К Рин же Обито относится совсем по-другому. Он без памяти влюблён в неё, однако, она этого не замечает. В день, когда Какаши повысили до звания Джонина, каждый член команды должен был подарить ему что-нибудь. Минато подарил ему один из своих особых кунаев, Рин - специальную удобную аптечку, Обито же ничего не подарил ему. Какаши было наплевать на это, и он просто проигнорировал этот поступок.

Когда, во время одной из миссий, Рин была похищена, Какаши, текущий руководитель группы, вместо её спасения, настаивал на продолжении миссии, соответствуя принципам идеального Шиноби. После этого, Обито заявил, что те, кто не спасают своих товарищей по команде, хуже мусора, и, в конечном счёте, сумел убедить друга присоединиться к нему.

Во время их спасательной операции, Какаши, в результате нападения вражеского шиноби, теряет левый глаз. Пытаясь спасти своего товарища, Обито пробуждает Шаринган, и обезвреживает противника.

Обнаружив Рин, ребята начали выбираться из пещеры, но враги, использовав технику Дотона, устроили обвал, и Обито попал под огромный камень, который придавил всю правую часть его тела. Неспособный идти дальше со своими товарищами, мальчик попросил Рин, в качестве подарка получившему звание Джонина Какаши, пересадить ему в левую глазницу свой Шаринган. Непосредственно перед смертью, он сожалеет, что не проводил больше времени со своими друзьями, и не признался Рин в своих чувствах.

Мадара и Обито — Тсуки но Ме Кейкаку

Спустя некоторое время, тяжело раненный Обито очнулся в комнате, где узнал, что его нашел, и спас от смерти, уже состарившийся Учиха Мадара. Взамен раздавленной части тела, Мадара пересадил ему половину искусственного тела Сенджу Хаширамы. В благодарность за спасение, Мадара предложил Обито отплатить свой долг. Тем не менее, Обито отказался помогать Мадаре, и пожелал вернуться к Какаши и Рин. Однажды, он узнал, что на Какаши и Рин напали вражеские Шиноби, и, при помощи спирального Зетсу, выбрался из Сангаку но Хакаба. Прибыв на место боя, он увидел, как Какаши убивает Рин при помощи Чидори. Увидев это, Обито пробудил свой Мангекё Шариган, поскольку он потерял близкого ему человека. Придя в ярость, Обито убивает всех Шиноби из Киригакуре. Тогда же, он понимает, что Мадара был прав. После возвращения к Мадаре, тот рассказал ему о своём плане, Рикудо Сеннине, и Джуби. Обито решил помочь ему, и отправился к Нагато, носителю глаз Мадары, представившись ему именем Мадары.

Попытка уничтожить Коноху

Когда бывший Джинчурики, Узумаки Кушина, рожала сына, появился Обито, и схватил новорожденного Наруто. Он вынудил Намиказе Минато спасти своего сына, и оставить при этом свою жену одну. Позже, Обито снял печать с живота Кушины, и, с помощью Шарингана, подчинил себе Кьюби. Кьюби начал уничтожать деревню, а Обито скрылся, после битвы с Намиказе Минато. Кушина и Минато запечатали Кьюби в Наруто, и, при этом, погибли сами.

Спустя несколько лет, он вернулся в Конохагакуре. Там, он встретил Учиха Итачи, которому предложил свою помощь в уничтожении клана Учиха. В обмен, Итачи потребовал с него слово, что он никогда не тронет Коноху и Учиха Саске.

Миссия по поиску Итачи

Обито — создатель Акацки, однако, кроме Пейна и Конан, больше никто не знает об этом. Более того, даже Пейн и Конан думают, что Акацки создал Яхико. Но, как выясняется позже, на самом деле, именно Обито навёл Яхико на мысль о создании организации. Позже, он вступает в Акацки, где становится подчиненным Зетсу, а затем, после смерти Сасори, полноправным членом организации. Его партнером становится Дейдара. После сражения с Саске, Дейдара взрывает самого себя. Так как Обито был там, и после этого не вернулся, все стали считать его мёртвым, но, вскоре, оказывается, что это не так.

Позже, он отдаёт Пейну приказ поймать Кьюби, и появляется только после битвы Саске против Итачи, загораживая дорогу шиноби из Конохи, которые ищут Саске.

Гокаге Кайдан

Обито излечивает раненного после битвы с Итачи Саске, и переносит его в пещеру. Там, он рассказывает ему о том, почему Итачи на самом деле уничтожил клан, и о его настоящем характере. Это заставляет Саске сотрудничать с Акацки, и задать своей команде новую цель — убийство Шимуры Данзо и старейшин Конохи. За это, Обито требует от Саске, чтобы он принёс Акацки Хачиби.

Позже, Саске узнаёт о Гокаге Каидан, и решает проникнуть туда, чтобы убить Данзо. После тяжелого сражения, Обито спасает Саске, телепортируя его в своё измерение. После этого, он рассказывает Каге свой план, и объявляет Четвертую мировую войну шиноби.

Обито наконец-то удаётся найти Данзо, и его сопровождающих. После короткого боя против Фу и Торуне, Обито абсорбирует их обоих, и телепортирует Саске к Данзо. Он наслаждается зрелищем издалека, в ожидании возможности забрать у Данзо Шаринган Учиха Шисуи, который позволяет контролировать разум противника. Ему это не удаётся, так как Данзо, перед смертью, уничтожает глаз, чтобы он не достался врагам. Вскоре после этого, появляются Наруто и Какаши, которые хотят от Саске ответов. После того, как Обито и Саске исчезают, последний просит Обито пересадить ему глаза Итачи.

Некоторое время спустя, появляется Кабуто, который предлагает Обито союз. Но тот хочет сначала проверить его, и ведет в своё подземное убежище.

Четвертая мировая война Ниндзя: Обратный отсчет

После смерти Кисаме, Обито отправляется на поиски Риннегана Нагато, чтобы использовать его силу. Для этого, ему нужно тело Нагато, которое спрятала Конан. Обито проникает в Амегакуре, и встречает Конан, которая не собирается отдавать ему тело Нагато, и хочет убить его. В коротком разговоре, он рассказывает Конан, что именно он дал Нагато Риннеган, и подтолкнул Яхико к созданию Акацки, и что теперь, он заберёт то, что принадлежит ему. Начинается новая битва.

В итоге, Конан погибает, а Обито лишается руки, половины маски, и, после использования Изанаги, левого Шарингана. Используя Гендзюцу на умирающей Конан, Обито узнаёт, где хранятся тела Нагато и Яхико. Забрав Риннеган, Обито встречается с Зетсу и Кабуто, надевая новый плащ, и новую маску с двумя отверстиями для глаз.

Акула приносит информацию, добытую Кисаме, и Обито объявляет Зетсу и Кабуто, что настало время захватить Кюби.

Четвертая мировая война Ниндзя: Конфронтация

После того, как план Кабуто захватить оставшихся Джинчурики проваливается, Обито начинает готовиться к войне. Между тем, он вставляет в свою левую глазницу Риннеган Нагато. Вместе с призванной Кабуто, с помощью Эдо Тенсей, армией возрождённых шиноби, и созданной Обито сотней тысяч белых Зетсу, которые передвигаются под землей, они отправляются на войну против Альянса. Обито временно скрывается в убежище. Когда Кабуто побеждает Митараши Анко, которая удивительно близко подобралась к убежищу, Кабуто советует Обито отправлялся на поле боя, чтобы сражаться, а он в это время будет находиться в тени, и контролировать свои войска. Однако, Обито подозревает, что Кабуто рассчитывает на то, что он и Альянс уничтожат друг друга. Обито уверен, что этот план заведомо обречен на провал, так как это он контролирует Кабуто, а не наоборот. Позже, Обито заставляет Кабуто рассказать ему всё о Эдо Тенсей, в том числе — как его остановить, чтобы Кабуто не направил свою армию против него самого. В течение войны, Обито решает завершить свой план, и призывает на поле битвы в Каминари но Куни Гедо Мазо. Чуть позже, он появляется с призванными Кабуто, с помощью Эдо Тенсей, Джинчурики, которых называет новыми "Пейн Рикудо".

С ними, Обито направляется к оставшимся Джинчурики - Наруто и Би. При встрече с ними, Наруто таранит своей головой голову Обито, после чего, оба разлетаются. Наруто спрашивает его, кто он такой, на что Обито отвечает, что он — никто, и не хочет быть кем-либо. Единственное, чего он хочет - завершить Тсуки но Ме Кейкаку. На протяжении битвы, появляются Гай и Какаши, и Наруто удаётся уничтожить Кокушин, который соединял Сон Гоку и Роши, после чего, Обито запечатывает Йонби в Гедо Мазо. Он заявляет, что не собирается провести вечность, сражаясь с Наруто и другими, и заставляет оставшихся Джинчурики принять форму их Биджу. В дальнейшем ходе сражения, Наруто удаётся вытащить все Кокушины из шей Биджу, вынуждая Обито запечатать их всех в Гедо Мазо.

Четвертая мировая война Ниндзя: Кульминация

Позже, он начинает возрождение Джуби, и выясняется, что у него такая же форма Мангекё Шарингана, что и у Какаши. В конечном счёте, его атакует Наруто в режиме Биджу, из-за чего, маска разлетается на части, раскрывая истинное лицо и личность Обито. На вопрос Какаши, как ему удалось выжить, Обито отвечает, что он выжил благодаря смерти Рин. После неудавшейся атаки, к Обито присоединяется Учиха Мадара. Обито отдаёт ему его Гунбай, и Мадара отправляется за Хачиби и Кьюби, в то время, как Обито предстаёт перед Гаем и Какаши. После возрождения Джуби, Обито решает перетянуть Наруто на свою сторону, пытаясь поставить его перед фактом пустоты жизни, и отчаяния после смерти его друзей. Позже, Обито отправляется вместе Какаши в измерение Камуи, где между ними начинается разговор. После разговора, Обито рассказывает Какаши о Рин, и о том, что он всё знал с самого начала. В последующем поединке, Какаши пронзает его грудь Райкири, и тот бежит из измерения Камуи. После его появления на голове Джуби, Мадара не видит другого выхода, и использует правую половину тела Обито, чтобы контролировать его, и заставляет использовать Ринне Тенсей, чтобы воскресить себя. После неудачной попытки, Обито становится Джинчурики Джуби.

Рождение Джинчурики Джуби

В последующей битве против Наруто, Саске и остальных Шиноби Альянса, Обито попадает в мир своих мыслей, где сталкивается с Наруто. Тот пытается отговорить его от Тсуки но Ме Кейкаку, и вернуть обратно на правильный путь. После отказа Обито, шиноби удаётся вытащить из тела Обито всех Биджу, после чего, его кожа начинает шелушиться, и тело принимает свой обычный облик. Затем, Обито падает на землю, вспоминая Рин. Куро Зетсу появляется из-под земли рядом с ним, захватывает его тело, и заставляет Обито воскресить Мадару при помощи Ринне Тенсей. Как известно, применивший эту технику — умирает. Куро Зетсу хочет забрать Риннеган Обито, поэтому, использует тело умирающего Обито в бою против Какаши и Минато.

Нападение Отсутсуки Кагуи

После воскрешения Мадары, тот захватывает всех Биджу, и запечатывает в себе вновь возрождённого Джуби. В попытке Мадары переманить Обито обратно на свою сторону, чтобы получить свой глаз, последний пронзает его, похищая часть чакры Хачиби и Ичиби, а также, часть Сенчакры Мадары, создавая в своей руке Шакуджо. В начавшейся битве против Мадары, Обито, контролируя Куро Зетсу, перемещает себя, Наруто и Сакуру в измерение Камуи, и запечатывает Янчакру Курамы в умирающего Наруто, тем самым, спасая его. Позже, он просит Сакуру уничтожить левый Риннеган Мадары, но та медлит, и Риннеган попадает в руки законного владельца. После предательства Куро, и возрождения Кагуи, Обито — один из немногих, кому удалось спастись от Муген Тсукуёми, благодаря Куро Зетсу. Сперва, он помогает Наруто, Саске, Сакуре и Какаши в битве против Кагуи и Куро, однако, затем, погибает, после попадания в него техники Отсутсуки.

Шаринган (写輪眼, "Копирующий глаз") — особенная техника, которая основана на Кеккей Генкай, ей обладает клан Учиха.

Мангекё Шаринган (万華鏡写輪眼 "Калейдоскоп копирующего вертящегося глаза") — расширенная форма Шарингана. Чтобы пробудить его нужно пережить тяжёлое эмоциональное потрясение.

Риннеган (輪廻眼, примерно "Глаз Самсары") — считается сильнейшим из всех Додзюцу. Обито вставляет его себе, после того как похищает его у Нагато.

Техники Шарингана

Гендзюцу: Шаринган (幻術・写輪眼, "Техника иллюзий: Копирующий вертящийся глаз") — Гендзюцу, которое используют члены Учиха Ичизоку. После того как пользователь смотрит в глаза своему оппоненту, он переносит его в Гендзюцу по своему усмотрению.

Изанаги (イザナギ) — техника клана Учиха, с которой можно предотвратить смерть жертвуя своим Шаринганом.

Камуи (神威, "Божье достоинство") — Додзюцу Мангекё Шарингана Учиха Обито, чья основная способность — телепортация. Принцип работы Камуи различается в зависимости от используемого глаза.

Техники Ринненгана

Гедо но Дзюцу (外道の術, "Техника внешнего пути") — Ниндзюцу, при котором пользователь может сделать из мёртвого тела марионетку и контролировать его. Для этого он должен вставить в них Кокушин. Они действуют как передатчики Чакры и позволяют пользователю управлять телами своей Чакрой как марионетками.

Гедо: Ринне Тенсей но Дзюцу (外道・輪廻天生の術, "Внешний путь: Техника реинкарнации небесной жизни") — Додзюцу Риннегана, используемое при помощи Гедо. С помощью этой техники пользователь может воскрешать мёртвых. Для этого он призывает идентичное с Джигокудо существо. Оно открывает пасть и выпускает души умерших, которые летят ко всем безжизненным телам в округе, воскрешая их.

Цепи Гедо Мазо — Додзюцу носителя Риннеганов, при котором он создаёт состоящую из Чакры цепь. Та обвивает шею Биджу, в глазах которого появляется Шаринган. Тем самым, пользователь может контролировать его.

Катон: Гокакью но Дзюцу (火遁・豪火球の術, "Высвобождение огня: Техника мощного огненного шара") — одна из простейших техник Катона. После формирования определенных печатей, изо рта пользователя изрыгается Чакра, преобразованная в огонь в форме шара.

Катон: Хосенка но Дзюцу (火遁・鳳仙火の術, "Высвобождение огня: Техника огня отшельника феникcа") — одна из простейших техник Катона. При ее использовании, пользователь выпускает из своего рта Чакру, преобразованную во множество огненных шаров.

Катон: Бакуфу Ранбу (火遁・爆風乱舞, "Высвобождение огня: Волна детонации Дикий танец") — Катонниндзюцу Учиха Обито, которое он впервые использует в четвертой мировой войне. При этой технике он с помощью Камуи создаёт вихрь, который пользователь снабжает огнём, после чего формируется огненная спираль, несущаяся вперёд на высокой скорости.

Учиха Каенджин (うちは火炎陣, "Пламенное формирование Учиха") — Кеккай Ниндзюцу Тоби, которое он впервые использует в битве против Наруто, Какаши и Гая. При этом на кончиках его пальцев образуются маленькие огоньки, после прикосновения ладони к земле, появляется барьер вокруг желаемого им объектом, который обжигает всё, что его касается.

Дотон: Могурагакуре но Дзюцу (土遁・土竜隠れの術, "Дотон: Техника скрытия крота") — техника для маскировки, при которой пользователь может прятаться под землей, чтобы его не нашли враги.

Могура Татаки но Дзюцу (土竜叩きの術, "Техника удара крота") — Ниндзюцу Учиха Обито, при котором он, используя Дотон: Могурагакуре но Дзюцу появляется перед оппонентом. В отличии от своего предшественника, это дзюцу используется в качестве нападения, а пользователь бьёт оппонента палкой.

Кибаку Джирай (起爆地雷, "Взрывные мины") — Ниндзюцу, которое Дейдара использует совестно с Тоби. После создания дракона C2, Дейдара создаёт множество бомб. Обито же прячет их под землей, что позволяет ничего не подозревающему оппоненту наступить на них и взорваться.

Мокутон: Сашики но Дзюцу (木遁・刺し木の術, "Высвобождение древесины: Техника пронзающего дерева") — Мокутонниндзюцу Учиха Обито, которое он использует в теле спирального Зетсу. При этом он создаёт из брони Зетсу несколько древесных игл, которыми он может пронзать противников. Эти шипы он может бросать как копья, или создавать усиленную версию, которая пронзает многих врагов сразу.

Мокутон: Дайджосу (木遁・大槍樹, "Высвобождение дерева: Великое древесное копьё") — Мокутонниндзюцу Учиха Обито, при котором он атакует врага с помощью множества древесных корней, вырывающихся из-под земли.

Биджудама (尾獣玉, "Шар хвостатого зверя") — сильнейшая способность Биджу, которую могут использовать и Джинчурики.

Гудодама (求道玉, "Ищущий правду шар") — чёрные сферы, которые используют Джинчурики Джуби. Они созданы из Онмьётона и, обычно, парят за или под пользователем, формируя круг из девяти сфер.

Мусеки Йоджин (六赤陽陣, "Формация шести красных Ян") — мощное Кеккай Ниндзюцу Учиха Обито, при котором он использует шесть приёмников чакры в качестве исходных точек барьера. Направляя в них свою чакру, Обито способен возвести барьер, достаточно мощный, что способен выдержать даже взрыв четырёх Биджудама.

Оружие из Чакры Биджу — техника, которую могут использовать Джинчурики после применения Чакры своих Биджу. После использования Чакры они могут использовать покров Биджу как оружие.

Фуиндзюцу: Генрью Кью Фуджин (封印術・幻龍九封尽, примерно "Техника печати: Печать девяти фантомных драконов") — техника, с помощью которой пользователь может абсорбировать Биджу.

Кайби Хоин (解尾法印, "Метод извлечения хвостатого") — Фуиндзюцу, изначально требующее ограничение в движениях Джинчурики. Перед извлечением, Биджу принимает вид чистой чакры, что также отражается на его Джинчурики. Затем Биджу извлекается из тела Джинчурики в своей истинной форме.

Канчи но Дзюцу (感知の術, "Техника зондирования") — Ниндзюцу, которое используют люди, способные ощущать чакру. Используя эту технику, Сенсоры могут без труда отследить источник чакры и выявить его местоположение. Диапазон этой техники зависит от мастерства пользователя.

Кучиёсе но Дзюцу (口寄せの術, "Техника призыва") — Джикукан Ниндзюцу, с помощью которого можно призвать объекты или живые организмы, даже людей из отдаленного места к своему месту нахождения.

Сайсей Нориоку (再生能力, "Способность к регенерации") — клетки Сенджу Хаширамы обладают свойством к быстрой регенерации, что дает возможность лечить травмы в считанные минуты.

Безымянное Фуиндзюцу — Ниндзюцу Учиха Мадары и Обито, которое они используют, чтобы запечатать в себе Джуби. Способность запечатать такое существо, как Джуби, свидетельствует о колоссальной силе печати.

Томегане но Дзюцу (遠眼鏡の術, "Техника телескопа") — Ниндзюцу, позволяющее пользователю следить за людьми через хрустальный шар, тем самым оставаясь незамеченным. Чтобы использовать данную технику пользователь должен хорошо управлять чакрой.

Хидзюцу: Эримаки Токаге (秘術・襟巻蜥蜴, "Секретная техника: Плащеносная ящерица") — техника Учиха Обито. Для её использования, он складывает нужные ручные печати и показывает свои ладони. Затем его плащ поднимается к его голове и выглядит как большой ворот. Видимо, у этой техники нет дальнейших воздействий.

1. Bunshin no Jutsu - техника ниндзюцу, которые изучают все ниндзя в академии. Буншин позволяет создавать копии ниндзя, без использования какого-либо вещества. Этот клон – абсолютная копия оригинала. Используется для отвлечения внимания и для сбивания врага с толку.

2. Henge no Jutsu - техника, которую изучают все ниндзя во время учебы в академии. Хенге позволяет ниндзя изменить свою внешность как на человеческую, так и принять форму предмета. Это позволяет обхитрить противника.

3. Kawarimi no Jutsu - основная техника нинджутсу. Когда нинзя в опасности, он быстро заменит себя на другой близлежащий объект. Это может быть бревно дерева или даже другой человек. Это позволяет нинзя быстро бежать и скрываться, в то время как первоначальный объект берет на себя удар нападения их противников.

4. Nawanuke no Jutsu - основная техника Нинджутсу, которая позволяет нинзя избавится от веревки, которая его связывает.

5. Kai - техника Нинджутсу, которая позволяет нинзя избегать эффектов иллюзии Генджутсу. После формирования необходиміх печатей рук, техника Генджутсу не затронет нинзя. Нинзя может также использовать технику на другом индивидууме, который не избежал нападения. После формирования необходимых ручных печатей, нинзя касается того, на которого воздействуют, чтобы вывести его из иллюзии.

6. Shunshin no Jutsu - основная техника ниндзюцу. Шиноби резко ускоряется, тем самым молниеносно отступает или нападает. В этой технике часто используются соседние элементы, типа тумана, песка, листьев и т.д., чтобы маскировать направление, куда переместился шиноби или же откуда.

7. Kinobori no Waza - искусство восхождения на дерево преследует двойную цель. Тренеруясь в Кинобори Шугуё (Обучение Восхождения по Дереву) помогает нинзя изучить управлению их чакрой. Также учит нинзя взбираться на вертикальные деревья и стены. Тренеровки помогают нинзя изучить, как сосредоточить правильное количество чакры в отдельной части их тела. Количество чакры, необходимое для поднятия, маленькое. Ноги расценены как самое самое трудный орган для сосредоточения чакры. Так, получая искусство этого навыка, нинзя теоретически сможет создать любое джутсу, так как они способны сосредоточить чакру как будет нужно.

8. Suimen Hokou no Waza - искусство ходьбы по водной поверхности позволяет нинзя идти по воде, как будто это твердая поверхность. Сосредотачивая чакру в подошвах ног, они могут балансировать на самой поверхности воды.