Клан Учиха - когда-то был сильнейшим кланом и являлся, наряду с Сенджу, одним из основателей Конохи. Члены клана обладали необычайным объемом чакры и Шаринганом. Учиха располагали собственным кварталом в деревне и формировали полицию Конохи. На ролевой вы можете стать как обычным членом клана, так и членом Полиции Конохи. Находясь в этом клане, вы можете активировать все ступени шарингана. Но поначалу у вас нет развитого додзюцу.
Мест в клане: 3
Состоящие в клане: Отсутствуют

Клан Узумаки - самый известный клан Деревни Скрытого Водоворота. Славился уникальными печатями и редким долголетием, поэтому джинчуурики для Курамы выбирали именно из этого клана. Клан Узумаки являлся дальним родственником клана Сенджу, поэтому всегда находился с ним в дружеских отношениях, также, как и их деревни - между Скрытым Листом и Скрытым Водоворотом существовал соответствующий альянс. В знак признательности и близких связей между деревнями и кланами, Коноха взяла себе символ Деревни Водоворота и стала пришивать его к различной одежде, эта традиция продолжалась даже когда Скрытый Водоворот был уничтожен. На ролевой у вас должны быть красные волосы, если являетесь членом этого клана. Также вы сможете иметь способности Карин к исцелению и способности к запечатыванию самого клана.
Мест в клане: 3
Состоящие в клане: Отсутствуют

Клан Сенджу - считался одним из сильнейших кланов, которого опасались другие. Долгое время данный клан был заклятым врагом клана Учиха. Присоединившись к клану вы сможете обладать сразу двумя стихиями - Суитон и Дотон. Однако создать из них кеккей генкай у вас не получится.
Мест в клане: 3
Состоящие в клане: Отсутствуют.

Клан Хозуки - члены клана обладают способностью превращать свои тела в жидкость с помощью техники гидратации. Однако, по-видимому, для поддержания этой способности необходимо избегать обезвоживания, так как минимум двое известных членов клана постоянно носили с собой бутыли с водой.
Мест в клане: 3
Состоящие в клане: Отсутствуют.

Клан Кагуя - известен своей жаждой битв и архаичными ценностями. Потомки Кагуи Ооцуцуки выборочно унаследовали производную от ее оригинальной способностью управлять структурой костей. Присоединившись к этому клану, вы сможете обладать кеккей генкаем Шикотсумьяку, который позволит вам управлять собственными костями. За счёт этого регенерация костей будет повышена.
Мест в клане: 3
Состоящие в клане: Отсутствуют.

Клан Хьюго - старейший и сильнейший из кланов Конохи. Клан делится на две ветви: главную и побочную. Побочная семья непосредственно служит главной, и членов побочной ветви обычно не обучают секретным техникам клана. В знак подчинения главной семье побочную клеймят проклятой печатью. Клан использует один из трех великих доудзюцу - Бьякуган, владеет уникальным стилем боя, основанным на повреждении системы циркуляции чакры. Использовав эту акцию, вы сможете обладать Бьякуганом без каких-либо ограничений, а также вы можете жить сами по себе, то есть командовать вами сможет лишь глава клана, в отличии от побочной ветви, которыми командуют главная ветвь.
Мест в клане: 3
Состоящие в клане: Отсутствуют

Военная Полиция Конохи - данная организация занималась соблюдением правопорядка в деревне и имела практически неограниченные полномочия. Тем не менее, она не могла вмешиваться в области, которые находились под прямым контролем Хокаге, к примеру, без надлежащего ордера арестовывать членов АНБУ. На ролевой вы будете подчиняться Фугаку, как офицеру полиции или же, если его нет, вы будете подчиняться игроку, который стал офицером полиции, также вы можете стать этим офицером. Как говорилось выше, у вас будут практически неограниченные полномочия. Вы будете получать зарплату.
Глава Полиции: Отсутствует.
Мест в организации: 4.

"Корень" АНБУ - они выполняют миссии, которые, как Данзо считает, пойдут на пользу Конохи. Главным приоритетом организации являются ее тайны, и большинство миссий осуществляются в строгой секретности. Корень был официально распущен в какой-то момент в прошлом, но оставался активным в качестве подпольной организации. На ролевой вы будете находится под руководством Данзо либо другого игрока. Стать главой Корня можете и вы. Если вы вступаете в Корень, вы получаете возможность выполнять миссии любого ранга, независимо от вашего ранга. В Корне отсутствует зарплата, но за миссии вы получаете больше денег, чем было указанно в самой миссии.
Глава "Корня": Отсутствует.
Мест в организации: 4
Состоящие в организации: Отсутствуют.

АНБУ - Особый отряд наёмных ниндзя, находящийся под непосредственным контролем Каге. Члены АНБУ защищают лидера деревни и само селение от исключительных угроз. Они проводят различного рода миссии, связанные с большим риском, будь то выслеживание кого-либо или же убийство врага, в том числе за границей. Они прекрасно разбираются в анатомии человеческого тела, на основе чего используют различные мощные техники, например дзюцу, парализующее противника. В случае смертельного ранения члены АНБУ самоуничтожают своё тело, чтобы противник не узнал о них никакой информации. На ролевой вы будете находится под контролем Хокаге, Цучикаге, Райкаге, Мизукаге и Казекаге. У вас не будет зарплаты, но ваши услуги будут оплачиваться.
Мест в организации: 4
Состоящие в организации: Отсутствуют.

Ойнины - их задача заключается, прежде всего, в поимке нукенинов, а затем в полном уничтожении их тел, для доказательства выполнения миссии оставляя лишь голову врага. Также, если Нукенин перед тем, как покинуть деревню, захватил с собой секреты своей родины, то основная задача Оининов - прежде всего добыть информацию, похищенную из своей деревни, а затем убить предателя. На ролевой вы будете под руководством Мизукаге. У ваших миссий не будет определённого ранга, но по умолчанию они стоят на ранге S, поэтому плата будет соответствующая. Также у вас имеется зарплата.
Мест в организации: 4
Состоящие в организации: Отсутствуют.